LFSを使う

LSFというものを使っている。忘れないようにメモ書き

基本的に

bsub -q QUE -o OUT "shell command"

で動く。例えば

bsub -q QUE -o OUT "pwd; ls"

とすると、OUTファイルにpwd; lsの結果、つまりカレントディレクトリとlsの結果が出力される。処理したい内容をmyscript.shに書いておいて

bsub -q mini_que -o my.log "bash myscript.sh"

とすれば良い。たくさん投げる場合

for l in {1..22}; do
  bsub -q mini_que -o myout_$l.log "bash myscript.sh $l"
done

とかすれば良い。gnu paralllelが使えれば

bsub -q mini_que -o myout.log "parallel myscript.sh ::: {1..22}"

がいけるようだが、例によって入ってなくて使えない。