aspera

asperaというソフトがある(https://www-01.ibm.com/software/jp/info/aspera/)。SRAやERAからのダウンロードはこちらが推奨されているらしい。FTPの100倍早いと。

https://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?list

のdirect downloadのリンクでシェルスクリプトがダウンロードされる。実行すると勝手にインストールされる。

使い方は

~/.aspera/connect/bin/ascp \
-i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh \
-QT -l100m \
anonftp@ftpprivate.ncbi.nlm.nih.gov:/1000genomes/ftp/phase3/data/NA18699/sequence_read \
TEST

でダウンロードできる。私の環境では100Mb/sでダウンロードできた。

コメント

このブログの人気の投稿

Inverse-normal transformation

SKAT

locuszoom